Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr3P51678 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr3P51678 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr3P51678 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr3P51678 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccr3P51678 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr3P51678 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr3P51678 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr3P51678 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr3P51678 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr3P51678 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr3P51678 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr3P51678 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr3P51678 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr3P51678 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr3P51678 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr3P51678 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr3P51678 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr3P51678 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr3P51678 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr3P51678 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr3P51678 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms