Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa9P50707 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa9P50707 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa9P50707 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa9P50707 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms