Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TspoP50637 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TspoP50637 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TspoP50637 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TspoP50637 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TspoP50637 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TspoP50637 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TspoP50637 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TspoP50637 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TspoP50637 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TspoP50637 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TspoP50637 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TspoP50637 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TspoP50637 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TspoP50637 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TspoP50637 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TspoP50637 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TspoP50637 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TspoP50637 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TspoP50637 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TspoP50637 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TspoP50637 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TspoP50637 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TspoP50637 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TspoP50637 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TspoP50637 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TspoP50637 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TspoP50637 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TspoP50637 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TspoP50637 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TspoP50637 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TspoP50637 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TspoP50637 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TspoP50637 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TspoP50637 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TspoP50637 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TspoP50637 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TspoP50637 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TspoP50637 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TspoP50637 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TspoP50637 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TspoP50637 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TspoP50637 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TspoP50637 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TspoP50637 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TspoP50637 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TspoP50637 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TspoP50637 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TspoP50637 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TspoP50637 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TspoP50637 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TspoP50637 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TspoP50637 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TspoP50637 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TspoP50637 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TspoP50637 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TspoP50637 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TspoP50637 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TspoP50637 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TspoP50637 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TspoP50637 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TspoP50637 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TspoP50637 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TspoP50637 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms