Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TubP50586 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TubP50586 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TubP50586 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TubP50586 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TubP50586 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TubP50586 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TubP50586 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TubP50586 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TubP50586 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TubP50586 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TubP50586 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TubP50586 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TubP50586 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TubP50586 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TubP50586 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TubP50586 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TubP50586 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TubP50586 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TubP50586 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TubP50586 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TubP50586 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TubP50586 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TubP50586 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TubP50586 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TubP50586 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TubP50586 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TubP50586 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TubP50586 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TubP50586 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TubP50586 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TubP50586 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TubP50586 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TubP50586 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TubP50586 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TubP50586 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TubP50586 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TubP50586 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TubP50586 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TubP50586 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TubP50586 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TubP50586 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TubP50586 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TubP50586 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TubP50586 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TubP50586 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TubP50586 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TubP50586 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TubP50586 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TubP50586 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TubP50586 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TubP50586 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TubP50586 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TubP50586 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TubP50586 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TubP50586 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TubP50586 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TubP50586 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TubP50586 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TubP50586 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TubP50586 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TubP50586 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TubP50586 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TubP50586 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TubP50586 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TubP50586 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TubP50586 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TubP50586 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TubP50586 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TubP50586 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TubP50586 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TubP50586 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TubP50586 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TubP50586 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TubP50586 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TubP50586 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TubP50586 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TubP50586 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TubP50586 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TubP50586 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TubP50586 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TubP50586 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TubP50586 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TubP50586 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TubP50586 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TubP50586 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TubP50586 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TubP50586 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TubP50586 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TubP50586 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TubP50586 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TubP50586 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms