Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-1P50220 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-1P50220 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-1P50220 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms