Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtpreP49446 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpreP49446 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtpreP49446 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpreP49446 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpreP49446 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpreP49446 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpreP49446 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpreP49446 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpreP49446 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpreP49446 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpreP49446 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms