Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnrnpa1P49312 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hnrnpa1P49312 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa1P49312 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnrnpa1P49312 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms