Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb42P49222 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb42P49222 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb42P49222 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb42P49222 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb42P49222 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb42P49222 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb42P49222 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb42P49222 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb42P49222 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb42P49222 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb42P49222 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Epb42P49222 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Epb42P49222 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Epb42P49222 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Epb42P49222 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb42P49222 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb42P49222 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb42P49222 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb42P49222 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb42P49222 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb42P49222 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb42P49222 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb42P49222 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Epb42P49222 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb42P49222 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb42P49222 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb42P49222 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb42P49222 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb42P49222 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb42P49222 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb42P49222 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Epb42P49222 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb42P49222 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Epb42P49222 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb42P49222 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb42P49222 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb42P49222 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Epb42P49222 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Epb42P49222 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb42P49222 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb42P49222 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb42P49222 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Epb42P49222 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Epb42P49222 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb42P49222 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Epb42P49222 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Epb42P49222 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb42P49222 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb42P49222 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb42P49222 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb42P49222 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb42P49222 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Epb42P49222 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms