Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox8bP48772 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox8bP48772 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms