Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PcntP48725 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PcntP48725 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PcntP48725 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PcntP48725 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PcntP48725 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PcntP48725 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcntP48725 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcntP48725 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcntP48725 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcntP48725 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PcntP48725 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PcntP48725 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PcntP48725 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PcntP48725 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcntP48725 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcntP48725 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcntP48725 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcntP48725 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PcntP48725 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PcntP48725 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PcntP48725 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PcntP48725 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PcntP48725 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PcntP48725 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PcntP48725 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PcntP48725 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PcntP48725 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PcntP48725 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PcntP48725 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PcntP48725 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PcntP48725 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PcntP48725 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PcntP48725 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PcntP48725 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PcntP48725 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcntP48725 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcntP48725 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcntP48725 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcntP48725 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcntP48725 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PcntP48725 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcntP48725 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcntP48725 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcntP48725 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcntP48725 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcntP48725 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcntP48725 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PcntP48725 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PcntP48725 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PcntP48725 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PcntP48725 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PcntP48725 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PcntP48725 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PcntP48725 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PcntP48725 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcntP48725 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcntP48725 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PcntP48725 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcntP48725 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PcntP48725 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PcntP48725 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PcntP48725 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PcntP48725 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PcntP48725 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PcntP48725 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PcntP48725 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PcntP48725 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PcntP48725 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PcntP48725 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PcntP48725 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PcntP48725 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PcntP48725 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PcntP48725 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PcntP48725 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PcntP48725 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PcntP48725 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PcntP48725 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PcntP48725 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PcntP48725 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PcntP48725 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PcntP48725 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PcntP48725 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PcntP48725 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PcntP48725 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PcntP48725 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms