Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CratP47934 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CratP47934 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CratP47934 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CratP47934 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CratP47934 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CratP47934 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CratP47934 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CratP47934 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CratP47934 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CratP47934 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CratP47934 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CratP47934 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CratP47934 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CratP47934 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CratP47934 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CratP47934 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CratP47934 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CratP47934 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CratP47934 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CratP47934 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CratP47934 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CratP47934 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CratP47934 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CratP47934 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CratP47934 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CratP47934 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CratP47934 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CratP47934 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CratP47934 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CratP47934 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CratP47934 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CratP47934 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CratP47934 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CratP47934 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CratP47934 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CratP47934 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CratP47934 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CratP47934 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CratP47934 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CratP47934 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CratP47934 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CratP47934 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CratP47934 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CratP47934 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CratP47934 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CratP47934 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CratP47934 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CratP47934 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CratP47934 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CratP47934 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CratP47934 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CratP47934 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CratP47934 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CratP47934 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CratP47934 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CratP47934 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CratP47934 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CratP47934 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CratP47934 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CratP47934 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CratP47934 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CratP47934 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CratP47934 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CratP47934 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CratP47934 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CratP47934 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CratP47934 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CratP47934 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CratP47934 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CratP47934 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CratP47934 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CratP47934 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CratP47934 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CratP47934 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CratP47934 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CratP47934 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CratP47934 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CratP47934 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CratP47934 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CratP47934 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CratP47934 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CratP47934 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CratP47934 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CratP47934 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CratP47934 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CratP47934 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CratP47934 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CratP47934 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CratP47934 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CratP47934 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CratP47934 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms