Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf4P47741 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf4P47741 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms