Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic1P46684 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic1P46684 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zic1P46684 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zic1P46684 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zic1P46684 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zic1P46684 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zic1P46684 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zic1P46684 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zic1P46684 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zic1P46684 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zic1P46684 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zic1P46684 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zic1P46684 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zic1P46684 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zic1P46684 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zic1P46684 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zic1P46684 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zic1P46684 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zic1P46684 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zic1P46684 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zic1P46684 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zic1P46684 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zic1P46684 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zic1P46684 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zic1P46684 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic1P46684 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic1P46684 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic1P46684 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zic1P46684 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zic1P46684 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zic1P46684 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms