Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf5P43027 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf5P43027 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms