Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sept1P42209 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sept1P42209 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sept1P42209 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sept1P42209 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sept1P42209 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sept1P42209 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sept1P42209 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sept1P42209 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sept1P42209 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sept1P42209 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sept1P42209 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sept1P42209 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sept1P42209 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sept1P42209 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sept1P42209 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept1P42209 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms