Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac1P41539 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tac1P41539 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tac1P41539 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tac1P41539 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tac1P41539 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tac1P41539 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tac1P41539 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tac1P41539 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tac1P41539 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tac1P41539 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms