Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csf3rP40223 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf3rP40223 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csf3rP40223 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Csf3rP40223 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms