Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf2P39429 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf2P39429 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf2P39429 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf2P39429 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf2P39429 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf2P39429 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Traf2P39429 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Traf2P39429 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf2P39429 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf2P39429 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf2P39429 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf2P39429 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Traf2P39429 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf2P39429 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf2P39429 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf2P39429 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf2P39429 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf2P39429 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf2P39429 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf2P39429 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms