Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtlP38585 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtlP38585 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtlP38585 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TtlP38585 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TtlP38585 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TtlP38585 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TtlP38585 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtlP38585 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtlP38585 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtlP38585 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtlP38585 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TtlP38585 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TtlP38585 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TtlP38585 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TtlP38585 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TtlP38585 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TtlP38585 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TtlP38585 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtlP38585 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtlP38585 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtlP38585 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtlP38585 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtlP38585 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtlP38585 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TtlP38585 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtlP38585 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtlP38585 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtlP38585 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtlP38585 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtlP38585 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtlP38585 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtlP38585 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TtlP38585 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TtlP38585 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TtlP38585 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TtlP38585 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TtlP38585 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TtlP38585 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtlP38585 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtlP38585 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtlP38585 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtlP38585 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtlP38585 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtlP38585 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtlP38585 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TtlP38585 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TtlP38585 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TtlP38585 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TtlP38585 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TtlP38585 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TtlP38585 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TtlP38585 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TtlP38585 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TtlP38585 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TtlP38585 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TtlP38585 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TtlP38585 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TtlP38585 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TtlP38585 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TtlP38585 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TtlP38585 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TtlP38585 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TtlP38585 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TtlP38585 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TtlP38585 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TtlP38585 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TtlP38585 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TtlP38585 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TtlP38585 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
TtlP38585 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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