Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lig1P37913 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lig1P37913 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lig1P37913 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig1P37913 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lig1P37913 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lig1P37913 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig1P37913 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lig1P37913 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lig1P37913 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig1P37913 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lig1P37913 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms