Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Flt1P35969 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Flt1P35969 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Flt1P35969 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Flt1P35969 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Flt1P35969 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Flt1P35969 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Flt1P35969 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Flt1P35969 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Flt1P35969 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Flt1P35969 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Flt1P35969 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Flt1P35969 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Flt1P35969 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Flt1P35969 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Flt1P35969 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Flt1P35969 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms