Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn1P35821 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn1P35821 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn1P35821 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn1P35821 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn1P35821 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn1P35821 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms