Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc1P35601 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfc1P35601 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms