Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab5cP35278 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab5cP35278 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab5cP35278 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms