Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp13P33435 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp13P33435 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms