Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdh15P33146 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh15P33146 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh15P33146 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms