Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Saa4P31532 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Saa4P31532 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Saa4P31532 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Saa4P31532 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Saa4P31532 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Saa4P31532 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Saa4P31532 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms