Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TbpP29037 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TbpP29037 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TbpP29037 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TbpP29037 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TbpP29037 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TbpP29037 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TbpP29037 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TbpP29037 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TbpP29037 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TbpP29037 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TbpP29037 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TbpP29037 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TbpP29037 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TbpP29037 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TbpP29037 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TbpP29037 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TbpP29037 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TbpP29037 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TbpP29037 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TbpP29037 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TbpP29037 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TbpP29037 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TbpP29037 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TbpP29037 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TbpP29037 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TbpP29037 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TbpP29037 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TbpP29037 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TbpP29037 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TbpP29037 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TbpP29037 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TbpP29037 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TbpP29037 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TbpP29037 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TbpP29037 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TbpP29037 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TbpP29037 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TbpP29037 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TbpP29037 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TbpP29037 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TbpP29037 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TbpP29037 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TbpP29037 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TbpP29037 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TbpP29037 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TbpP29037 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TbpP29037 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TbpP29037 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TbpP29037 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TbpP29037 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TbpP29037 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TbpP29037 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TbpP29037 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TbpP29037 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TbpP29037 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TbpP29037 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TbpP29037 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TbpP29037 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TbpP29037 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TbpP29037 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TbpP29037 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TbpP29037 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TbpP29037 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TbpP29037 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TbpP29037 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TbpP29037 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TbpP29037 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TbpP29037 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TbpP29037 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TbpP29037 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TbpP29037 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TbpP29037 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TbpP29037 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms