Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RxraP28700 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RxraP28700 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RxraP28700 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RxraP28700 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RxraP28700 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxraP28700 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxraP28700 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxraP28700 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxraP28700 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxraP28700 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxraP28700 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxraP28700 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxraP28700 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxraP28700 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxraP28700 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxraP28700 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxraP28700 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxraP28700 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxraP28700 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxraP28700 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RxraP28700 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxraP28700 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RxraP28700 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxraP28700 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxraP28700 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxraP28700 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RxraP28700 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxraP28700 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxraP28700 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxraP28700 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxraP28700 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxraP28700 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxraP28700 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxraP28700 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxraP28700 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RxraP28700 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxraP28700 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxraP28700 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxraP28700 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxraP28700 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxraP28700 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxraP28700 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxraP28700 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxraP28700 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxraP28700 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxraP28700 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxraP28700 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxraP28700 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RxraP28700 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RxraP28700 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RxraP28700 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RxraP28700 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RxraP28700 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RxraP28700 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxraP28700 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxraP28700 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxraP28700 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxraP28700 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxraP28700 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxraP28700 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxraP28700 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RxraP28700 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxraP28700 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxraP28700 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RxraP28700 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxraP28700 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxraP28700 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxraP28700 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxraP28700 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxraP28700 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxraP28700 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxraP28700 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxraP28700 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxraP28700 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxraP28700 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxraP28700 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxraP28700 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxraP28700 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxraP28700 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxraP28700 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxraP28700 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxraP28700 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxraP28700 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxraP28700 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxraP28700 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxraP28700 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxraP28700 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxraP28700 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxraP28700 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxraP28700 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxraP28700 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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