Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col2a1P28481 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col2a1P28481 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col2a1P28481 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms