Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa3P28310 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa3P28310 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa3P28310 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa3P28310 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa3P28310 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa3P28310 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms