Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LoxP28301 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LoxP28301 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LoxP28301 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LoxP28301 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LoxP28301 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LoxP28301 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LoxP28301 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LoxP28301 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LoxP28301 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LoxP28301 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LoxP28301 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LoxP28301 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LoxP28301 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LoxP28301 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LoxP28301 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LoxP28301 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LoxP28301 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LoxP28301 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LoxP28301 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LoxP28301 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LoxP28301 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LoxP28301 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LoxP28301 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LoxP28301 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LoxP28301 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LoxP28301 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LoxP28301 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LoxP28301 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LoxP28301 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LoxP28301 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LoxP28301 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LoxP28301 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LoxP28301 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LoxP28301 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LoxP28301 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LoxP28301 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LoxP28301 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LoxP28301 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LoxP28301 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LoxP28301 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LoxP28301 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LoxP28301 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LoxP28301 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LoxP28301 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LoxP28301 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LoxP28301 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LoxP28301 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LoxP28301 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LoxP28301 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LoxP28301 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LoxP28301 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LoxP28301 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LoxP28301 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LoxP28301 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LoxP28301 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LoxP28301 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LoxP28301 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LoxP28301 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LoxP28301 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LoxP28301 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LoxP28301 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LoxP28301 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LoxP28301 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LoxP28301 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LoxP28301 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LoxP28301 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LoxP28301 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LoxP28301 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LoxP28301 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LoxP28301 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LoxP28301 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LoxP28301 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LoxP28301 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms