Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb3P28231 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb3P28231 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb3P28231 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms