Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CenpbP27790 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CenpbP27790 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CenpbP27790 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CenpbP27790 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CenpbP27790 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CenpbP27790 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpbP27790 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpbP27790 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CenpbP27790 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms