Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,11■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17,11■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Twist1P26687 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,08■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,06■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17,02■□□□□ 0,32
Twist1P26687 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Twist1P26687 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,02■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17,01■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,01■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Twist1P26687 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Twist1P26687 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,98■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16,98■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16,97■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Twist1P26687 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Twist1P26687 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Twist1P26687 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,95■□□□□ 0,3
Twist1P26687 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Twist1P26687 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,95■□□□□ 0,3
Twist1P26687 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Twist1P26687 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,4 ms