Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax3P24610 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax3P24610 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pax3P24610 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pax3P24610 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pax3P24610 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pax3P24610 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pax3P24610 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pax3P24610 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pax3P24610 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pax3P24610 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pax3P24610 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pax3P24610 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pax3P24610 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms