Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja1P23242 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja1P23242 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja1P23242 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja1P23242 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja1P23242 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja1P23242 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja1P23242 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja1P23242 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja1P23242 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gja1P23242 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja1P23242 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja1P23242 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms