Protein–RNA interactions for Protein: P22366

Myd88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myd88P22366 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myd88P22366 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myd88P22366 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myd88P22366 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Myd88P22366 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Myd88P22366 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Myd88P22366 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Myd88P22366 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Myd88P22366 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myd88P22366 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myd88P22366 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myd88P22366 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myd88P22366 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myd88P22366 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myd88P22366 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myd88P22366 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myd88P22366 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Myd88P22366 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Myd88P22366 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myd88P22366 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Myd88P22366 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Myd88P22366 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myd88P22366 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Myd88P22366 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myd88P22366 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myd88P22366 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myd88P22366 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Myd88P22366 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Myd88P22366 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myd88P22366 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myd88P22366 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Myd88P22366 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myd88P22366 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Myd88P22366 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Myd88P22366 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myd88P22366 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myd88P22366 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myd88P22366 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms