Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb4P21440 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb4P21440 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcb4P21440 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms