Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnnc2P20801 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnc2P20801 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms