Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ntf3P20181 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ntf3P20181 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ntf3P20181 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms