Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VimP20152 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VimP20152 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VimP20152 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VimP20152 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VimP20152 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VimP20152 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VimP20152 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VimP20152 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VimP20152 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VimP20152 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VimP20152 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VimP20152 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VimP20152 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VimP20152 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VimP20152 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VimP20152 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VimP20152 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VimP20152 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VimP20152 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VimP20152 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VimP20152 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VimP20152 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VimP20152 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VimP20152 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VimP20152 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VimP20152 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VimP20152 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VimP20152 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VimP20152 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VimP20152 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VimP20152 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VimP20152 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VimP20152 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VimP20152 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VimP20152 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VimP20152 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VimP20152 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VimP20152 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VimP20152 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VimP20152 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VimP20152 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VimP20152 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VimP20152 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VimP20152 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VimP20152 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VimP20152 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VimP20152 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VimP20152 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VimP20152 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VimP20152 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VimP20152 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VimP20152 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VimP20152 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VimP20152 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VimP20152 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VimP20152 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VimP20152 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VimP20152 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VimP20152 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VimP20152 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VimP20152 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VimP20152 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VimP20152 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VimP20152 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VimP20152 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VimP20152 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VimP20152 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VimP20152 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VimP20152 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VimP20152 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VimP20152 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VimP20152 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VimP20152 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VimP20152 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VimP20152 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VimP20152 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VimP20152 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VimP20152 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VimP20152 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VimP20152 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VimP20152 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VimP20152 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VimP20152 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VimP20152 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VimP20152 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VimP20152 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VimP20152 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VimP20152 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VimP20152 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VimP20152 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VimP20152 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VimP20152 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VimP20152 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VimP20152 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VimP20152 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VimP20152 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VimP20152 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VimP20152 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VimP20152 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms