Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csn1s1P19228 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csn1s1P19228 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms