Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lama1P19137 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lama1P19137 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lama1P19137 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama1P19137 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama1P19137 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lama1P19137 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama1P19137 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lama1P19137 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lama1P19137 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lama1P19137 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lama1P19137 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama1P19137 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama1P19137 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama1P19137 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lama1P19137 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama1P19137 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lama1P19137 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lama1P19137 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama1P19137 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lama1P19137 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lama1P19137 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lama1P19137 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lama1P19137 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama1P19137 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lama1P19137 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama1P19137 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lama1P19137 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama1P19137 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lama1P19137 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lama1P19137 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lama1P19137 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lama1P19137 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lama1P19137 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lama1P19137 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lama1P19137 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lama1P19137 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lama1P19137 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lama1P19137 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lama1P19137 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lama1P19137 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lama1P19137 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lama1P19137 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms