Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18530 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18530 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18530 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18530 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18530 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18530 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18530 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18530 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18530 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18530 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18530 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18530 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P18530 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18530 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
P18530 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P18530 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P18530 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P18530 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P18530 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P18530 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18530 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18530 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18530 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18530 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18530 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18530 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18530 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P18530 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18530 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18530 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18530 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18530 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18530 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18530 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18530 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18530 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18530 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18530 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18530 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18530 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18530 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18530 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18530 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18530 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P18530 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P18530 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18530 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18530 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18530 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18530 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18530 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18530 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18530 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P18530 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P18530 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P18530 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P18530 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P18530 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P18530 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P18530 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P18530 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P18530 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms