Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgfb3P17125 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb3P17125 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms