Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CnpP16330 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CnpP16330 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CnpP16330 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CnpP16330 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CnpP16330 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CnpP16330 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CnpP16330 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CnpP16330 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CnpP16330 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CnpP16330 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CnpP16330 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CnpP16330 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CnpP16330 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CnpP16330 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CnpP16330 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CnpP16330 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CnpP16330 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CnpP16330 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CnpP16330 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CnpP16330 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CnpP16330 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CnpP16330 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CnpP16330 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CnpP16330 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CnpP16330 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CnpP16330 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CnpP16330 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CnpP16330 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CnpP16330 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CnpP16330 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CnpP16330 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CnpP16330 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CnpP16330 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CnpP16330 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CnpP16330 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CnpP16330 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CnpP16330 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CnpP16330 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CnpP16330 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CnpP16330 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CnpP16330 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CnpP16330 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CnpP16330 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CnpP16330 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CnpP16330 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CnpP16330 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CnpP16330 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CnpP16330 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CnpP16330 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CnpP16330 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CnpP16330 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CnpP16330 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CnpP16330 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CnpP16330 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CnpP16330 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CnpP16330 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CnpP16330 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CnpP16330 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CnpP16330 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CnpP16330 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CnpP16330 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CnpP16330 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CnpP16330 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CnpP16330 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CnpP16330 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CnpP16330 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CnpP16330 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CnpP16330 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CnpP16330 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CnpP16330 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CnpP16330 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CnpP16330 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CnpP16330 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CnpP16330 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CnpP16330 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CnpP16330 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CnpP16330 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CnpP16330 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CnpP16330 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CnpP16330 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CnpP16330 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CnpP16330 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CnpP16330 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CnpP16330 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CnpP16330 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CnpP16330 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CnpP16330 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CnpP16330 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CnpP16330 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CnpP16330 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CnpP16330 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms