Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1P13405 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1P13405 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1P13405 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1P13405 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1P13405 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1P13405 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1P13405 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1P13405 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1P13405 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1P13405 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 546.9 ms