Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr4a1P12813 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr4a1P12813 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms