Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MdkP12025 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MdkP12025 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MdkP12025 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MdkP12025 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MdkP12025 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MdkP12025 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MdkP12025 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MdkP12025 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MdkP12025 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MdkP12025 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MdkP12025 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MdkP12025 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MdkP12025 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MdkP12025 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MdkP12025 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MdkP12025 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MdkP12025 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MdkP12025 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MdkP12025 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MdkP12025 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MdkP12025 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MdkP12025 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MdkP12025 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MdkP12025 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MdkP12025 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MdkP12025 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MdkP12025 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MdkP12025 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MdkP12025 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MdkP12025 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MdkP12025 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MdkP12025 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MdkP12025 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MdkP12025 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MdkP12025 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MdkP12025 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MdkP12025 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MdkP12025 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MdkP12025 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MdkP12025 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MdkP12025 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MdkP12025 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MdkP12025 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MdkP12025 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MdkP12025 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MdkP12025 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MdkP12025 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MdkP12025 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MdkP12025 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MdkP12025 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MdkP12025 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MdkP12025 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MdkP12025 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MdkP12025 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MdkP12025 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MdkP12025 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MdkP12025 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MdkP12025 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MdkP12025 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MdkP12025 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MdkP12025 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MdkP12025 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MdkP12025 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MdkP12025 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MdkP12025 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MdkP12025 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MdkP12025 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MdkP12025 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MdkP12025 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MdkP12025 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MdkP12025 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MdkP12025 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MdkP12025 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MdkP12025 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MdkP12025 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MdkP12025 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MdkP12025 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MdkP12025 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MdkP12025 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MdkP12025 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MdkP12025 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms